큰 자궁 내막성 물혹이 있거나 심한 자궁내막증 치료에는 수술 치료 방법이 가장 많이 쓰입니다. 눈에 보이는 병소를 되도록 모두 제거하고 유착은 떼어 줌으로써 골반 장기의 정상 구조를 회복시키며 때로는 통증 전단 신경을 차단하여 통증을 줄이거나 없애는 것입니다.
▣ 근본적 수술 자궁과 난소를 제거하면서 그외의 부위에 있는 병소도 지지거나 잘라내는 치료 방법입니다. 나이가 꽤 들었고 임신을 원하지 않으며 병소가 광범위하거나 증상이 심할 때 시행됩니다. 근본적 수술을 하면 재발 가능성이 거의 없지만 유착이 심하면 수술시 장이나 방광 또는 수뇨관 등의 손상으로 합병증 위험이 많아지고 인위적 폐경으로 인한 문제가 생깁니다.
▣ 보존적 수술 난소 기능을 조금이라도 남기는 것이며 이런 치료만으로도 큰 효과가 있습니다.
△ 소작 치료 : 열, 전기, 레이저 등으로 지지거나 증발시키는 방법으로 작은 병소가 복막 등 눈으로 보이는 곳에 있을 때 주로 쓰입니다. △ 자궁 내막성 물혹 절제 : 난소는 남겨 두고 혹만 잘라내는 방법입니다. △ 난소 보존 : 젊은 여성에서는 출산을 마쳤더라도 되도록 난소의 일부를 남겨 두는 보존적 수술 방법을 택하는 것이 좋습니다. 보통 한쪽 난소를 떼어내는데 혹이 클 때 적응증입니다. 병이 있는 부분과 함께 한쪽 난소와 자궁만 들어내도 재발하지 않는 환자가 많습니다. △ 신경 절제 수술 : 통증을 없애려고 등뼈의 끝 부분인 천골 앞을 지나가는 신경을 끊으면 월경통은 좋아지는데 요통, 하복통, 성교통 등에 대한 효과는 불명확합니다. 또한 대변이나 소변을 보는 기능이 저하될 수 있으며 출혈, 수술 후 유착 등 부작용이 생길 수 있습니다.
▣ 수술 치료후 임신율 경증이나 중등증에서는 1년에 약 50%로 높은 편이라고 여기지만 약물 치료나 치료하지 않은 경우와 비교하여 별 차이가 없다는 연구도 많기 때문에 큰 자궁 내막성 물혹이 없으면서 불임증 치료 목적으로 수술할 때는 잘 생각해야 합니다.
중증으로 심한 병이 있을 때는 임신율이 30-40%로 줄어드는데 그래도 치료하지 않을 때보다 높은 임신율을 보입니다. 임신되는 환자의 대부분은 수술하고 나서 1년 안에 임신됩니다. 특히 자궁 내막성 물혹을 수술하여 없애 주면 몇 개월 안에 임신이 잘 되는 것을 알 수 있습니다.
▣ 수술 치료후 재발률 수술 방법과 개인의 체질에 따라서 다른데 증상의 재발이 1년 반에 약 20%, 5년에 40%, 등으로 연구자에 따라 차이가 있습니다. 약물 치료보다는 재발률이 낮습니다.
자궁내막증 
자궁내막증의 수술치료 
큰 자궁 내막성 물혹이 있거나 심한 자궁내막증 치료에는 수술 치료 방법이 가장 많이 쓰입니다. 눈에 보이는 병소를 되도록 모두 제거하고 유착은 떼어 줌으로써 골반 장기의 정상 구조를 회복시키며 때로는 통증 전단 신경을 차단하여 통증을 줄이거나 없애는 것입니다.